• 主题
高级搜索  >
历史搜索 清空历史
首页> 外文OA文献 >A method to avoid errors associated with the analysis of hypermutated viral sequences by alignment-based methods
【2h】

A method to avoid errors associated with the analysis of hypermutated viral sequences by alignment-based methods

机译：一种避免基于比对的方法与超突变病毒序列分析相关的错误的方法

代理获取
本网站仅为用户提供外文OA文献查询和代理获取服务，本网站没有原文。下单后我们将采用程序或人工为您竭诚获取高质量的原文，但由于OA文献来源多样且变更频繁，仍可能出现获取不到、文献不完整或与标题不符等情况，如果获取不到我们将提供退款服务。请知悉。
页面导航
  • 摘要
  • 著录项
  • 相似文献
  • 相关主题

摘要

© 2015 Elsevier Inc. The human genome encodes for a family of editing enzymes known as APOBEC3 (apolipoprotein B mRNA editing enzyme, catalytic polypeptide-like3). They induce context dependent G-to-A changes, referred to as "hypermutation", in the genome of viruses such as HIV, SIV, HBV and endogenous retroviruses. Hypermutation is characterized by aligning affected sequences to a reference sequence. We show that indels (insertions/deletions) in the sequences lead to an incorrect assignment of APOBEC3 targeted and non-target sites. This can result in an incorrect identification of hypermutated sequences and erroneous biological inferences made based on hypermutation analysis.
机译：©2015 Elsevier Inc.。人类基因组编码称为APOBEC3（载脂蛋白B mRNA编辑酶，催化性多肽样3）的编辑酶家族。它们在诸如HIV，SIV，HBV和内源性逆转录病毒等病毒的基因组中诱导上下文相关的G-to-A变化，称为“超突变”。超突变的特征在于将受影响的序列与参考序列比对。我们显示序列中的插入/缺失（插入/缺失）导致对APOBEC3目标和非目标位点的错误分配。这可能导致对超突变序列的错误识别以及基于超突变分析做出的错误生物学推论。

著录项

相似文献

  • 外文文献
  • 中文文献
  • 专利
代理获取

客服邮箱：kefu@zhangqiaokeyan.com

京公网安备：11010802029741号 ICP备案号：京ICP备15016152号-6 六维联合信息科技 (北京) 有限公司©版权所有

  • 客服微信

  • 服务号